Недавно (в конце 2017 года) были обнаружены уязвимости процессоров Meltdown и Spectre.
Microsoft оперативно выпустил обновления для своих операционных систем.
Эти обновления привели к невозможности запуска сервиса публикации (PublishingTools service failed to start) и других сервисов геообработки. Данная проблема проявилась во всех версиях ArcGIS Server, установленных на ОС Windows Server 2008 R2 и Windows 7 (https://support.esri.com/en/Technical-Article/000017464).
Причем следует отметить, что в ряде случаев сервис PublishingTools не запускается, а PublishingToolsEx работает нормально.

Проблема с сервисами геообработки ArcGIS Server появляется при установке обновления ОС:
— KB4056894: 2018-01 Security Monthly Quality Rollup for Windows Server 2008 R2 for x64-based Systems
или при установке комбинации следующих двух обновлений.
— KB4056568: Cumulative security update for Internet Explorer
— KB4056897: January 3, 2018 Security-Only Update

Для устранения этих проблем Esri выпустил обновления для всех поддерживаемых версий ArcGIS Server: https://support.esri.com/en/download/7576. После установки обновления следует вручную запустить необходимые сервисы, если они не запустятся автоматически.

Несмотря на то, что поддержка ОС Windows Server 2008 R2 и Windows 7 будет осуществляться до начала 2020 года, Esri рекомендует обновить серверные ОС до более современных и защищенных ОС, например, Windows Server 2016. Перед обновлением ОС не забудьте проверить, поддерживается ли новая ОС доступной вам версией ArcGIS Server (http://enterprise.arcgis.com/ru/system-requirements/latest/windows/arcgis-server-system-requirements.htm)

Подробности, касающиеся проблемы с запуском сервисов геообработки, вы можете узнать в сообщении от Esri.