Подобная статья уже была написана для версии 10.3.1.
Новая версия тоже не лишена «сюрпризов». По мере знакомства с ними, мы будем дополнять эту статью.

  • #BUG-000094576 Upgrading Portal for ArcGIS 10.3.1 to 10.4 fails if Collector and/or Survey123 was previously registered with the Portal. Если Collector и/или Survey123 были зарегистрированы в Portal 10.3.1, то при миграции появляется ошибка: «Error in migration. Failed to update the database schema from version 10.3.1 to version 10.4.0 during migration». Данная проблема решается предварительной разрегистрацией Collector и/или Survey123 в Portal for ArcGIS.
  • Несмотря на то, что приложения 10.3.1 и 10.4 не могут нормально сосуществовать на одном компьютере, некоторые инсталяторы не проверяют наличие/отсутствие других продуктов на этом компьютере. Например: на компьютере были установлен Desktop 10.3.1 и Server 10.3.1, запускаем установку Server 10.4, в процессе установки Server 10.3.1 деинсталируется и ставится 10.4, но Desktop 10.3.1 остается. Сделано это не по ошибке, а специально из-за большого количества появившихся разных продуктов ArcGIS. Так что следить за синхронизацией версий ПО ArcGIS теперь придется системным администраторам самостоятельно. В связи с этим еще одно замечание: предыдущая русификация деинсталируется только перед установкой последующая русификации, так что за старыми русификациями тоже стоит присматривать (см. Панель управленияПрограммы и компоненты).

Дополнение от 18.03.2016. Обнаружен следующий баг в ArcGIS for Server 10.4: если в MXD-проекте используются данные из MS SQL 2012 (либо два слоя, либо слой и таблица), между ними в проекте создан join (соединение), MXD-проект опубликован как картографический сервис в ArcGIS Server, то при идентификации объектов основного слоя отображается только один атрибут. Идентификация работает одинаково и при работе с сервисом в ArcMap, и в веб-приложении. При использовании данных из других типов СУБД, или файловой БГД, или из шейп-файлов идентификация не «ломается». Баг зарегистрирован под номером BUG-000094955: Identify operation unable to show attributes of a feature class in a map service having a join published to ArcGIS Server 10.4, when data source is MS SQL 2012.
Варианты обхода проблемы: использование другой СУБД или файловой БГД, использование Query Layer c join в запросе к данным, использование relate (Связи) вместо join, использование класса отношений, использование View (представления) в БД c join в запросе к данным.

Дополнение от 19.04.2016. Обнаружен следующий баг в ArcGIS for Desktop 10.4: модель геообработки созданная в ArcCatalog открывается в ArcMap в искаженном виде, так что в ArcMap ее уже невозможно нормально отредактировать. После сохранения в ArcMap такая модель будет и в ArcCatalog открываться в искаженном виде:

Исправляется довольно просто: нужно установить десятичный разделитель «точка» для чисел и для денег. Делается это в региональных установках операционной системы.
В некоторых случаях сохраненная модель «ломается» описанным образом и в ArcCatalog при установленном десятичном разделителе «точка» для чисел и для денег.
Ошибка зарегистрирована под номером [BUG-000096078 : Changing decimal symbols from periods/dots to commas under Regional settings in the Numbers and Currency tabs breaks tools in existing models.] 27.04.2016 выпущено исправление этой ошибки: ArcGIS 10.4 for Desktop ModelBuilder Regional Language Display Patch.
Дополнение от 09.06.2016. Установка этого обновления приведит к тому, что модели, созданные или пересохраненные после установки этого обновления открываются в 10.4.1 в искаженном виде. Надо отметить, что сама 10.4.1 работает с моделями корректно и другие модели открывает тоже корректно.
Решить проблему в 10.4.1 с такими «испорченными патчем» моделями совсем просто:
— создаем новую пустую модель
— в старой модели выделяем все элементы, нажимаем Copy
— вставляем их в новую пустую модель, сохраняем
— старую модель выбрасываем.
Дополнение от 23.06.2016. Для версии 10.4.1 также выпущен ArcGIS 10.4.1 for Desktop ModelBuilder Regional Language Display Patch. И это обновление более правильное. Если его установить, то «испорченными патчем» модели открываются нормально, и версия 10.4.1 с установленным патчем корректно сохраняет модели, так что они читаются версией 10.4.1 и без этого патча.

Дополнение от 10.05.2016. Особенности обновления БГД до версии 10.4.
Больше не поддерживается MS SQL Server 2008 и 2008 R2. И после обновления БГД данные будут недоступны: http://support.esri.com/es/knowledgebase/techarticles/detail/46427.
В качестве решения проблемы с такой недоступной бпазой такую БД можно обноить до версии MS SQL Server 2012 или 2014 средствами самого MS SQL.
Обновить БГД до версии 10.4 следует при помощи инструмента «Обновить базу геоданных», выполнив требования для обновления , см соответствующий раздел справки.
Опционально нужно обновить настройки сервисов для разрешения смены пароля, см. соответствующий раздел справки.